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學術報告
植物保護學院青年教師創新沙龍(第31期)
發布日期:2020-11-10 瀏覽次數: 信息來源:植保學院 字號:[ ]

題目Bumble bee genomes: what are boring, interesting and promising

時間2020-11-26(周四)下午300-600

地點:新植保樓3060A 會議室

報告人:孫成博士,中國農業科學院蜜蜂研究所研究員、博士生導師。

孫成研究員于2009年博士畢業于中國科學院遺傳與發育生物學研究所,20092月至20158月先后在美國德克薩斯大學阿靈頓分校、科羅拉多州立大學做博士后研究。201510月入選中國農業科學院“青年英才計劃”引進人才,到蜜蜂研究所工作,主要從事熊蜂進化與功能基因組學研究。近5年在我國本土熊蜂基因組解析、基因調控區域注釋、熊蜂基因及基因組進化的分子機制方面取得了一系列進展。目前以第一或通訊作者身份在Molecular Biology and EvolutionBMC BiologyScientific DataGenome Biology and EvolutionBMC Genomics等國際重要刊物上發表論文10余篇,文章被Nature Reviewers GeneticsF1000等作為研究亮點進行評述。

近年來代表性論文

1) Sun C*, Huang J, Wang Y, Zhao X, Su L, Thomas GWC, Zhao M et al. 2020. Genus-wide characterization of bumblebee genomes provides insights into their evolution and variation in ecological and behavioral traits. Molecular Biology and Evolution. msaa240. (). Highlighted in Nature Reviews Genetics (http://doi.org/10.1038/s41576-020-00294-9).

2) Zhao X, Su L, Xu W, Schaack S, Sun C*. 2020. Genome-wide identification of accessible chromatin regions in bumblebee by ATAC-seq. Scientific Data. 7: 367.

3) Zhao X, Su L, Schaack S, Sadd BM, Sun C*. 2018. Tandem repeats contribute to coding sequence variation in bumblebees (Hymenoptera: Apidae). Genome Biology and Evolution 10(12):3176–3187.

4) Sun C, Feschotte C, Wu Z, Mueller RL. 2015. DNA transposons have colonized the genome of the giant virus Pandoravirus salinus. BMC Biology. 13(1): 38.

5) Sun C, Mueller RL. 2014. Hellbender genome sequences shed light on genomic expansion at the base of crown salamanders. Genome Biology and Evolution. 6(7): 1818-1829.  

  1. Sun C, Wyngaard G, Walton DB, Wichman HA, Mueller RL. 2014. Billions of basepairs of recently expanded, repetitive sequences are eliminated from the somatic genome during copepod development. BMC Genomics. 15(1): 186. 

  2. Sun C, López Arriaza JR, Mueller RL. 2012. Slow DNA loss in the gigantic genomes of salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(12): 1340-1348.

    (F1000 recommendation: )

  3. Sun C, Shepard DB, Chong RA, López Arriaza J, Hall K, Castoe TA, Feschotte C, Pollock DD, Mueller RL. 2012. ?LTR retrotransposons contribute to genomic gigantism in plethodontid salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(2): 168–183.

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